Komplexní molekulárně genetická studie, která nám umožňuje identifikovat genetický materiál nejpravděpodobnějších původců akutních střevních infekcí ve stolici a stanovit etiologii onemocnění.

Ruská synonyma

Synonyma Anglicky

Screening akutních střevních infekcí; Screening bakteriálního a virového průjmu, PCR, vzorky stolice.

Metoda výzkumu

Polymerázová řetězová reakce v reálném čase.

Jaký biomateriál lze použít pro výzkum?

Jak se správně připravit na studium?

  • Studii se doporučuje provést před zahájením podávání antibiotik a jiných antibakteriálních chemoterapeutických léků.
  • 72 hodin před odběrem stolice se vyvarujte užívání projímadel, podávání rektálních čípků, olejů, omezte užívání léků ovlivňujících motilitu střev (belladonna, pilokarpin aj.) a barvu stolice (železo, vizmut, síran barnatý).

Obecné informace o studiu

Akutní střevní infekce (AI) jsou skupinou onemocnění způsobených viry, bakteriemi nebo parazity, která se vyznačují fekálně-orálním přenosovým mechanismem. Běžnými faktory přenosu těchto infekcí jsou potraviny, voda, kontaminované předměty z domácnosti a špinavé ruce. První příznaky se objevují několik hodin nebo dní po infekci, nástup je náhlý, s výskytem častých řídkých stolic, zvracení, bolestí břicha a známek intoxikace (horečka, zimnice, nevolnost). Onemocnění může mít skupinovou povahu a může se objevit u několika lidí, kteří konzumovali kontaminované potraviny nebo vodu.

Podle oficiálních statistik tvoří v Rusku až 65–67 % onemocnění této skupiny akutní střevní infekce blíže nespecifikované etiologie. Pokud není původce infekce znám, je účinnost protiepidemických opatření omezená. Poměr četnosti detekce virových a bakteriálních patogenů se v různém věku liší: u dětí do 3 let tvoří virová agens 80-90 % onemocnění, bakteriální agens tvoří 10-20 %; Mezi dospělými pacienty klesá podíl virových patogenů na 30 %.

Druhy Shigella a Esherichia coli jsou gramnegativní tyčinkovité mikroorganismy z čeledi Enterobacteriaceae. Rod Shigella zahrnuje patogenní bakterie S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii a S. sonnei, které jsou původci shigelózy (bakteriální úplavice). Enteroinvazivní E. coli (EIEC) jsou velmi blízké Shigella, syntetizují a vylučují Shigella-like toxin, jsou schopny pronikat do buněk střevní sliznice a ničit enterocyty, což vede ke vzniku ulcerózních defektů ve střevní sliznici. Enteroinvazivní escherichióza je zodpovědná za významnou část případů „bakteriologicky nepotvrzené úplavice“, zejména u dětí.

ČTĚTE VÍCE
Jak je kyselina nikotinová užitečná pro ženy?

Bakterie rodu Salmonella patří do čeledi Enterobacteriaceae. S. typhi a S. parathyphi jsou původci břišního tyfu a paratyfu. Existuje mnoho sérovarů druhů Salmonella, které mohou způsobit infekci u lidí, jako je gastroenterokolitida, a také způsobit nozokomiální infekce. Salmonelóza se může objevit ve formě akutní střevní infekce, těžké generalizované infekce nebo asymptomatického nosičství. Konečná diagnóza je stanovena až po izolaci patogenu nebo detekci jeho DNA.

Campylobacter je jedním z nejobtížněji kultivovatelných mikroorganismů (což je vyžadováno během analýzy). To se vysvětluje jejich mikroaerofilitou a možností potlačení jejich růstu doprovodnou flórou. Rod Campylobacter zahrnuje jak původce akutních infekcí (termofilní druhy), tak saprofytické a oportunní druhy, na které je třeba pamatovat při identifikaci těchto mikroorganismů v klinickém materiálu. Použití souprav na bázi PCR ke stanovení termofilní skupiny kampylobakterií umožňuje nejen vyhnout se pracné a nákladné bakteriologické práci, ale také jednoznačně omezit detekci těch druhů kampylobakterií, které mají etiologickou souvislost s akutní střevní infekcí (C. jejuni, C. coli, C. lari, C. uppsaliensis).

Norovirus je podle údajů zahraniční literatury nejčastějším původcem propuknutí akutních respiračních infekcí nebakteriální etiologie. Tato vlastnost je spojena s nízkou infekční dávkou a vysokou perzistencí v prostředí. PCR je „zlatým standardem“ v klinické diagnostice norovirových infekcí.

Astroviry i přes svou o něco nižší prevalenci ve srovnání s rota- a noroviry tvoří významnou skupinu střevních infekcí, které se s kolitidou vyskytují u třetiny pacientů. Rotaviry skupiny A jsou nejčastější příčinou sporadických akutních respiračních infekcí u dětí a adenovirus F obsahující DNA (sérotypy 40 a 41) často způsobuje propuknutí gastroenteritidy u malých dětí.

K identifikaci a diferenciální diagnostice střevních infekcí se používají kulturní a molekulárně genetické metody ke studiu genetického materiálu patogenu ve stolici a stanovení koncentrace specifických imunoglobulinů v krvi. PCR má oproti kultivačním metodám výhodu díky rychlé produkci výsledků, vysoké specificitě a citlivosti studie. Tato analýza umožňuje identifikovat původce střevního onemocnění se 100% přesností a rychlá diagnostika akutních střevních infekcí pomáhá vyhnout se zbytečným zákrokům a chirurgickým zákrokům, zahájit léčbu včas a omezit zdroj infekce.

K čemu slouží výzkum?

  • Stanovit etiologický faktor akutní střevní infekce;
  • pro diferenciální diagnostiku příčin akutní gastroenterokolitidy (zánět trávicího traktu).
ČTĚTE VÍCE
Jaký je rozdíl mezi vínovou a vínovou?

Kdy je studium naplánováno?

  • S příznaky akutní gastroenteritidy, pravděpodobně infekční etiologie (řídká, častá stolice, zvracení, horečka, bolesti břicha);
  • se současným nebo sekvenčním rozvojem akutních střevních infekcí u několika členů rodiny, u dětí v dětském ústavu nebo u pacientů v nemocnici;
  • při podezření na rozvoj nozokomiální střevní infekce (s exacerbací příznaků enterokolitidy u pacienta léčeného pro akutní střevní infekce).

Co znamenají výsledky?

Referenční hodnoty: negativní.

Důvody pro pozitivní výsledek:

  • přítomnost DNA nebo RNA původce akutních střevních infekcí; etiologie v závislosti na typu identifikovaného patogenu (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2. genotyp), Astrovirus).

Důvody negativního výsledku:

  • nepřítomnost infekce Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2. genotyp), Astrovirus.

Důležité poznámky

  • Doporučuje se provést studii v prvních 3 dnech od začátku onemocnění, u hospitalizovaných pacientů – v první den hospitalizace.
  • Je důležité si uvědomit, že akutní enterokolitida může být způsobena jinými infekcemi (například améby, lamblie, yersinie, klostridie, protey atd.) nebo neinfekčními příčinami (toxiny, toxické látky, akutní střevní neprůchodnost, mezenterická cévní trombóza, zánětlivá onemocnění střev, akutní pankreatitida, apendicitida, celiakie, akutní hepatitida, malabsorpce, divertikulitida).

Také doporučeno

  • Yersinia pseudotuberculosis, DNA [PCR]
  • anti-Shigella flexneri 1–5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
  • Kultivace stolice pro patogenní flóru (skupina onemocnění a skupina tyfoparatyfu)
  • Kultivace stolice pro oportunní flóru se stanovením citlivosti na antibiotika
  • Analýza stolice na protozoální cysty
  • Klinický krevní test: obecná analýza, vzorec leukocytů, ESR (s mikroskopií krevního nátěru k detekci patologických změn)

Kdo si studium objedná?

Specialista na infekční choroby, gastroenterolog, terapeut, pediatr.

Literatura

  • Borisov L. B. Lékařská mikrobiologie, virologie, imunologie. M.: MIA, 2005. – 736 s.
  • Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detekce E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae a Campylobacter spp. enteropatogeny pomocí tříreakční multiplexní PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. leden 2009; 63(1): 1–9. PMCID: PMC2701628.

Analýza pro intestinální skupinu provádí k identifikaci patogenu v akutní střevní infekce. Za normálních okolností by výkaly neměly obsahovat žádnou patogenní flóru.

ČTĚTE VÍCE
Jaká barva se hodí k hnědému obleku?

V případě akutní infekce taková studie umožňuje přesně určit typ patogenu a předepsat potřebnou léčbu. V lidském střevě žijí mikroorganismy různých typů. Některé z nich mají normální střevní mikroflóru a za žádných okolností nezpůsobují onemocnění. Jiné se nazývají oportunní a vykazují negativní účinky za určitých podmínek (snížená imunita, nerovnováha mikroflóry). Třetí skupina by za normálních okolností neměla být v těle přítomna a její zjištění jasně ukazuje na onemocnění.

Příprava na studium:

  • 3 dny před testem vylučte kořeněná jídla a alkohol;
  • od posledního jídla do sběru materiálu musí uplynout minimálně 8 hodin;
  • materiál se odebírá před zahájením léčby antibakteriálními a chemoterapeutickými léky nebo 14 dní po poslední dávce léku.

Studijní charakteristiky:

  • Typ biomateriálu: výkaly, rektální nátěr
  • Synonyma (rus): Analýza stolice pro střevní skupinu
  • Synonyma (eng): Kultura střevních patogenů
  • Metody výzkumu: očkování na živnou půdu
  • Dodací lhůta: 3-5 dní

Proč se provádí test stolice pro střevní skupinu?

  1. Pokud existují známky akutní gastrointestinální infekce – identifikovat a určit typ patogenu.
  2. Stanovení citlivosti patogenu na antibiotika pro výběr nejoptimálnější možnosti léčby.
  3. Při absolvování povinné lékařské komise – k potvrzení nepřítomnosti infekce nebo přepravy.

Význam analýzy

Střeva jsou domovem velkého množství mikroorganismů. U zdravých lidí jsou ve správném poměru, takže nevznikají žádné příznaky gastrointestinálních patologií. Pokud se zvýší hladina jakéhokoli infekčního agens nebo pronikne nový mikroorganismus, zdravotní stav osoby se zhorší. Nejprve se rozvine průjem, zvracení, nevolnost, pak se objeví další příznaky malátnosti. Je důležité provést léčbu včas. K tomu je nutné určit přesný typ patogenu a léky, na které je citlivý. Za tímto účelem se pro střevní skupinu provádí mikrobiologické vyšetření stolice.

To poskytuje lékaři a pacientovi následující výhody:

  • identifikace přesného patogenu, který způsobil příznaky střevní infekce;
  • vyloučení mikroorganismů, které nemohly způsobit tuto infekci;
  • stanovení antibiotik, ke kterým mají identifikované patogenní mikroorganismy vysoký, střední a nízký stupeň citlivosti;
  • vyhýbání se užívání léků, na které není vůbec žádná citlivost, díky čemuž bude léčba neúčinná a patogen se bude dále množit;
  • výběr léčby v závislosti na anamnéze osoby, přítomnosti nebo nepřítomnosti kontraindikací určitých léků;
  • schopnost včas zahájit terapii dříve, než se vyvinou komplikace pro gastrointestinální trakt nebo jiné vnitřní orgány;
  • kontrola předepsané léčby, která určuje účinnost eliminace patogenů, které způsobují negativní příznaky;
  • vyloučení rizika užívání nesprávných léků, které nejenže nepovedou k účinku, ale mohou také způsobit nežádoucí účinky.
ČTĚTE VÍCE
Kde se vyrábí nejchutnější zmrzlina na světě?

Střevní infekce je nebezpečná pro zdraví a život. Proto je nutné rychle identifikovat příčinu příznaků a podstoupit léčbu. V tomto procesu je důležité vyhnout se dehydrataci, která je často pozorována u střevních infekcí.

Indikace

Obvykle se analýza neprovádí pro preventivní účely. Předepisuje se pouze při patologické příznaky střevní infekce:

  • nevolnost, zvracení, bolest břicha;
  • příměs hnisu nebo krve ve stolici;
  • prodloužený, přetrvávající průjem, způsobující odstranění velkého množství tekutiny z těla;
  • známky dehydratace – suchost a snížený kožní turgor, vpadlé oči, popraskané rty, sucho v ústech;
  • obecné známky malátnosti – slabost, únava, letargie, náhlá ztráta síly;
  • zvýšení teploty u některých pacientů, ale střevní infekce může projít i bez ní (hypertermie zhoršuje dehydrataci, což vede ke komplikacím);
  • křeče, které se vyvíjejí v důsledku dehydratace (jsou zvláště nebezpečné, když jsou děti infikovány a mohou vést k neurologickým poruchám a poškození mozkové tkáně).

Stav se vyvíjí rychle a vyžaduje okamžitou léčbu. Nejčastěji je pacient umístěn v nemocnici. Při podezření na infekci je okamžitě předepsáno mikrobiologické vyšetření stolice pro střevní skupinu.

Pokrok výzkumu

K provedení analýzy je nutné odebrat biologický materiál. Provede se výtěr z řitního otvoru nebo se odebere malá část čerstvé stolice. Výsledný vzorek je umístěn do sterilní nádoby a odeslán do laboratoře. Je nepřípustné používat k testu cizí nádoby, protože obsahují vlastní mikroflóru, která může ovlivnit výsledek. Dále se test provádí po etapách.

  1. Doprava do laboratoře. Vzorek lze skladovat ne déle než 1-2 hodiny. Okamžitě se odešle do laboratoře, kde studie začíná, aby se mikroflóra nestihla uvnitř vzorku rozmnožit a způsobit zkreslení výsledku.
  2. Příprava zásob. K rozboru budete potřebovat Petriho misku s živnou půdou, na které rychleji porostou bakterie. K vytvoření preparátu je navíc připraven mikroskop a barviva.
  3. Sejení. Pomocí špachtle rozprostřete biologický materiál po povrchu živného média v rovnoměrné vrstvě. Upravte teplotu a vlhkost na vyšší parametry, aby mikroflóra rostla rychleji. V tomto stavu může být nutné ponechat růstové médium po dobu 3-5 dnů, dokud nedojde k růstu bakterií. Pokud zcela chybí, je výsledek negativní a analýza se zastaví. Pokud se růst rozšíří, provede se další vyšetřování.
  4. Mikroskopie. Po 3-5 dnech se vyrostlé kolonie bakterií přenesou do skla. Je podroben barvení, protože bez této fáze zůstanou bakterie bezbarvé a nebude je možné vidět. Po obarvení se sklíčko umístí do mikroskopu a obraz se zobrazí v 10 polích. Posuzuje se složení mikroflóry, přičemž se identifikují patogenní bakterie, které mohou způsobit střevní infekci. Údaje se zadávají do formuláře.
  5. Výběr antibiotik. Pokud je identifikována patogenní mikroflóra, jsou pro ni vybírány různé skupiny antibiotik, na které je rozdílná citlivost. Tyto údaje se přenášejí i do formuláře.
ČTĚTE VÍCE
Jaké kapky si koupit, když je vaše oko zanícené?

Po dokončení všech fází je formulář analýzy kompletně vyplněn a předán pacientovi. Dekódování by měl provádět terapeut, pediatr, specialista na infekční onemocnění nebo jiný lékař zapojený do léčby. Pouze on bude schopen vybrat správný lék, přičemž vezme v úvahu jak výsledky studie, tak anamnézu pacienta. Normálně by neměla existovat jediná patogenní enterobakterie, která způsobuje střevní infekci. Mohou být přítomny další mikroorganismy oportunní mikroflóry, ale v normálních mezích.

Mikrobiologická kultivace stolice pro střevní skupinu umožňuje určit diferenciální diagnózu gastrointestinální infekce, i když jsou příznaky podobné jiné patologii. Na živném médiu mohou růst jak oportunní mikroorganismy, tak patogenní bakterie. Proto se dodatečně provádí mikroskopie, jejímž prostřednictvím laboratorní lékař zjišťuje přítomnost či nepřítomnost salmonel a shigel.

Normy pro analýzu stolice pro střevní skupinu

Patogenní enterobakterie (salmonella, shigella) – ne.

Interpretace analýzy stolice pro střevní skupinu

  • negativní výsledek: v testovaném vzorku nebyla zjištěna žádná střevní skupina;
  • pozitivní výsledek: v testovaném vzorku byla zjištěna salmonela, shigella.